A Coleção Iconográfica do MHJC foi subdividida nas Subcoleções Desenhos (pigmentos secos, como crayon e bico de pena), Esculturas (objeto tridimensional de material diverso), Fotografias (imagens em papel por meio da exposição luminosa) e Pinturas[...]
A Coleção Etnológica do Museu de História Julio de Castilhos contém objetos dos povos originários tanto nacionais quanto internacionais.
A Coleção Escravatura é composta por objetos utilizados como instrumento de suplício e de castigo no período da escravização.
A Coleção Documentos contém textos variados relacionados ao Museu de História Julio de Castilhos ou à história do Rio Grande do Sul e seus protagonistas, que aqui serão inseridos progressivamente.
A Coleção Brinquedos é composta por objetos de equipamentos lúdicos e jogos.
A Coleção Regionalismo contém objetos que representam costumes e tradições do Rio Grande do Sul, enquanto a Coleção Arreamento contém objetos de outras regiões.
As Coleções Arquitetura e Arte Náutica reúnem peças históricas, como chaves, sinos, pregos, bússolas, miniaturas e fragmentos, representando práticas construtivas e de navegação.
As Coleções Armaria e Heráldica são compostas por uma variedade de armas, projéteis, escudos e brasões.
